Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRIM16O95361 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM16O95361 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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