Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TO15178 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TO15178 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TO15178 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TO15178 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TO15178 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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