Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms