Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DKK3Q9UBP4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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