Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms