Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SLC6A20Q9NP91 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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