Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC3GQ9HC16 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms