Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB17Q9H0T7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RAB17Q9H0T7 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms