Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CIPCQ9C0C6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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