Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIFKQ9BYG3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms