Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB2BQ9BVA1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms