Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBXN4Q92575 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms