Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC8DQ7L1W4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC8DQ7L1W4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms