Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms