Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms