Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTXN3Q4LDR2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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