Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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