Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CCDC142Q17RM4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CCDC142Q17RM4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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