Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TAF1AQ15573 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TAF1AQ15573 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TAF1AQ15573 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TAF1AQ15573 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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