Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC10A1Q14973 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SLC10A1Q14973 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms