Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALCAMQ13740 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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