Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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