Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GOLGA4Q13439 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms