Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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