Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FOXO1Q12778 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FOXO1Q12778 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FOXO1Q12778 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FOXO1Q12778 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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FOXO1Q12778 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXO1Q12778 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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