Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUCB1Q02818 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms