Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DSC2Q02487 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms