Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRA2BP62995 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRA2BP62995 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms