Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ERVK-16P61578 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms