Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TPTEP56180 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TPTEP56180 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TPTEP56180 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TPTEP56180 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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