Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL23P55773 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL23P55773 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms