Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NESP48681 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NESP48681 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NESP48681 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NESP48681 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms