Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR1P43307 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms