Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms