Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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HOXD10P28358 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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