Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HLA-DMAP28067 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms