Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms