Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MMP11P24347 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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MMP11P24347 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MMP11P24347 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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