Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms