Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PGA3P0DJD8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms