Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALUO43852 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALUO43852 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALUO43852 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALUO43852 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms