Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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