Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms