Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCND1Q9NSA2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms