Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRDM5Q9NQX1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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