Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FANCFQ9NPI8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FANCFQ9NPI8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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