Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4GALTQ9NPC4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms