Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM6Q9C030 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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