Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms