Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPERQ9BY12 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCAPERQ9BY12 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms